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head命令

本节重要性：★★★★☆    本节难度：★★★☆☆

如果一个文件很大，而您只想看看其中的一小部分，那么有两个命令可能适合您：head和tail。根据名字您也能猜出，一个是查看文件头部，另一个是查看文件尾部。首先我们来看一下head命令。

命令用途

显示文件内容头部

命令格式

head [option] [file]

常用选项

-n k	显示文件的前k行。

常见用法

head的用法比较简单，不带参数的head默认显示文件的前10行：

[peter@ibi98 ~]$ head /home/pub/seq/TAIR9_cds_20090619
>AT1G51370.2 | Symbols:  | F-box family protein | chr1:19045615-19046748 FORWARD
ATGGTGGGTGGCAAGAAGAAAACCAAGATATGTGACAAAGTGTCACATGAGGAAGATAGG
ATAAGCCAGTTACCGGAACCTTTGATATCTGAAATACTTTTTCATCTTTCTACCAAGGAC
TCTGTCAGAACAAGCGCTTTGTCTACCAAATGGAGATATCTTTGGCAATCGGTTCCTGGA
TTGGACTTAGACCCCTACGCATCCTCAAATACCAATACAATTGTGAGTTTTGTTGAAAGT
TTTTTTGATTCCCACAGGGATTCATGGATACGCAAACTCCGTTTAGATTTGGGTTATCAT
CATGATAAGTATGATCTCATGTCATGGATTGATGCTGCGACTACGCGTAGGATTCAGCAT
CTTGATGTTCATTGTTTTCACGATAATAAGATACCCTTGAGCATATATACATGCACGACG
TTGGTACACTTACGACTCCGTTGGGCTGTCTTGACTAATCCCGAGTTTGTTTCCTTACCT
TGTCTGAAGATCATGCATTTTGAAAATGTTAGCTATCCCAATGAGACCACGTTGCAGAAA

如果只想显示前5行：

[peter@ibi98 ~]$ head -n 5 /home/pub/seq/TAIR9_cds_20090619
>AT1G51370.2 | Symbols:  | F-box family protein | chr1:19045615-19046748 FORWARD
ATGGTGGGTGGCAAGAAGAAAACCAAGATATGTGACAAAGTGTCACATGAGGAAGATAGG
ATAAGCCAGTTACCGGAACCTTTGATATCTGAAATACTTTTTCATCTTTCTACCAAGGAC
TCTGTCAGAACAAGCGCTTTGTCTACCAAATGGAGATATCTTTGGCAATCGGTTCCTGGA
TTGGACTTAGACCCCTACGCATCCTCAAATACCAATACAATTGTGAGTTTTGTTGAAAGT

或者简写为head -5：

[peter@ibi98 ~]$ head -5 /home/pub/seq/TAIR9_cds_20090619
>AT1G51370.2 | Symbols:  | F-box family protein | chr1:19045615-19046748 FORWARD
ATGGTGGGTGGCAAGAAGAAAACCAAGATATGTGACAAAGTGTCACATGAGGAAGATAGG
ATAAGCCAGTTACCGGAACCTTTGATATCTGAAATACTTTTTCATCTTTCTACCAAGGAC
TCTGTCAGAACAAGCGCTTTGTCTACCAAATGGAGATATCTTTGGCAATCGGTTCCTGGA
TTGGACTTAGACCCCTACGCATCCTCAAATACCAATACAATTGTGAGTTTTGTTGAAAGT

下面的例子，是查看压缩文件的前4行。（压缩文件不能直接用head查看，这里利用管道将zcat和head组合起来完成查看压缩文件的部分内容）

[peter@ibi98 ~]$ zcat /home/pub/seq/at_protein.fa.gz |head -4
>AT1G51370.2 | Symbols:  | F-box family protein | chr1:19045615-19046748 FORWARD
MVGGKKKTKICDKVSHEEDRISQLPEPLISEILFHLSTKDSVRTSALSTKWRYLWQSVPG
LDLDPYASSNTNTIVSFVESFFDSHRDSWIRKLRLDLGYHHDKYDLMSWIDAATTRRIQH
LDVHCFHDNKIPLSIYTCTTLVHLRLRWAVLTNPEFVSLPCLKIMHFENVSYPNETTLQK
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